首都醫科大學血管外科學系于2013年12月正式成立，2018年上半年完成換屆調整工作，依托附屬北京安貞醫院醫院，聯合宣武醫院、附屬北京友誼醫院、附屬北京朝陽醫院、附屬北京同仁醫院、附屬北京天壇醫院、附屬北京世紀壇醫院和電力教學醫院、平谷教學醫院、石景山教學醫院、大興教學醫院、良鄉教學醫院、潞河教學醫院、密云教學醫院、懷柔教學醫院共15 家醫療機構的血管外科及相關科室組成。目前血管外科學系共有醫師125人，其中中國科學院院士1人；博士生導師4人，碩士生導師8人；教授7人，副教授9人；主任醫師20人，副主任醫師35人，主治醫師40人，住院醫師30人。
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首都醫科大學血管外科學系全面整合了學校范圍內本學科資源，在臨床、教學、科研及人才培養諸方面充分發揮集團優勢，臨床、教學及科研力量雄厚。
整合后的血管外科學系達到總床位數309張，近五年共收治住院病人27927人次，門診病人325290人次，急診4932人次。三級以上介入及手術21451臺。學系內各醫院血管外科發展各有特色：宣武醫院、安貞醫院的整體實力，以及宣武醫院的布加綜合征外科治療、大動脈炎外科與腔內微創治療、糖尿病下肢缺血綜合治療和血管新生治療，腹腔鏡技術治療主髂動脈閉塞，安貞醫院的主動脈疾病腔內微創治療，世紀壇醫院的靜脈疾病的治療，朝陽醫院的頸動脈腔內治療及友誼醫院的大動脈疾病外科治療等在國內本專業占有領先地位，某些方面在國際上具有一定影響力。
學系各成員單位均承擔了首都醫科大學的教學任務，有較好的教學基礎。學系擁有博士后流動站，博士和碩士培養點，和一批優秀的教師隊伍。截止到2013年12月，血管外科學系現有博士研究生導師4人；碩士研究生導師8人；近五年培養博士后出站1人，畢業博士研究生21人；畢業碩士研究生32人；在讀博士6人，碩士26人。近五年培養全國進修醫生150人。2013年宣武、安貞、朝陽醫院均獲批為國家衛計委外周血管介入診療培訓基地，可以為全國培養更多的外周血管介入人才。
各成員單位有著良好的科研基礎和較好的科研人員梯隊和管理經驗，承擔著多項國家級和省部級科研課題。近五年申請各類科研課題近40項，其中國家級項目11項，省部級項目21項，總經費累積5836萬元。近五年累計發表中文學術論文300篇，發表SCI論文40篇。主編及參編專著及教材12部。正在承擔的國家級、市局級課題項目近20項，可支配研究經費1000余萬元。獲得北京市級成果二等獎1項，中華醫學科技三等獎1項。
血管外科學系建設的總體規劃是“搭建平臺、夯實基礎”，為實現血管外科學系跨越式發展創造條件、積累資本、蓄積力量；以學科建設為基礎，堅持醫、教、研并重的原則，實現學系整體水平的提高；完善管理制度的建設，凝聚人心，創建和諧，建立可持續發展的基礎；建設和保持高水平的學科骨干隊伍，為建設高水平研究型醫科大學貢獻力量。
