首都醫科大學腎病學系于2008年4月成立，經過多年建設發展，學系由最初11家成員單位發展到現在30家成員單位，學系擁有博士學位點、碩士學位點及博士后流動站，是學校腎病學科醫療、教學、科研為一體的高級人才培養基地。學系掛靠單位為附屬北京友誼醫院，學系主任由中日友好醫院李文歌教授擔任。
腎病學系擁有國內外知名的學科帶頭人隊伍，多人擔任歷屆中華醫學會腎臟病學分會的副主任委員、常委等，擔任歷屆北京醫學會腎臟內科分會的主任委員、副主任委員、北京醫學會血液凈化學分會主任委員、副主任委員等。學系目前擁有博士生導師12名，碩士生導師14名。近三年，腎病學系發表學術論文150余篇，SCI收錄論文50余篇，牽頭承擔國家科技支撐計劃、國家自然科學基金（含重大國際合作課題、重點項目）、行業科研專項等國家級課題5項，其它省部級課題6項。
腎病學系具有豐富的臨床資源，在30家成員單位中，三甲醫院15家、三級綜合醫院14家、二甲醫院1家。腎病學系的臨床特色專科是血液凈化，在常規血液凈化方面，學系擁有血透/血濾機1406臺，血透患者5500余例，透析機數量占北京市數量31.2%，透析患者人數占北京市34.7%。學系掛靠單位附屬北京友誼醫院作為北京市血液凈化質量控制與改進中心主任單位（2014-2022年），2023年學系成員單位中日友好醫院接任成為主任單位（現名“北京市腎內科與血液凈化質量控制和改進中心”）。學系血液凈化水平居于全國領先地位。李文歌和劉文虎兩位主任以副主編身份參與編寫了《血液凈化標準操作規程》（2021版）；劉文虎主任牽頭制定了《北京市血液凈化臨床質量控制標準》（試行）。在非常規血液凈化方面，學系能夠開展血漿置換、血漿吸附等血液凈化治療，主要應用于自身免疫性疾病清除致病物質。2022年4月，附屬北京友誼醫院開展了蛋白A免疫吸附清除PRA抗體治療，成為學系內首個開展蛋白A免疫吸附治療的腎內科，也成為北京地區最早開展蛋白A免疫吸附的單位之一。成員單位附屬北京天壇醫院，除開展常規腎內科疾病治療外，近年來開展的血漿吸附治療項目，可針對性清除血漿特定物質，對視神經脊髓炎譜系病、重癥肌無力、格林巴利等自身免疫性神經系統疾病治療取得良好治療效果，并積累了豐富治療和科研經驗。成員單位附屬北京兒童醫院腎病科自2012年開始建立非典型溶血尿毒綜合征（aHUS）的隊列研究，是國內最大的aHUS 罕見病隊列。
經過多年建設發展，腎病學系形成了自己的臨床和科研特色，在國內具有一定知名度。今后學系將繼續深入整合學系資源，更加注重臨床與基礎相結合，內科與外科結合，腎病學科與多學科結合，在腎臟病學領域取得具有實際成效的理論及技術創新，不斷進取，實現新突破。
